Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms