Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tubb4aQ9D6F9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tubb4aQ9D6F9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tubb4aQ9D6F9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tubb4aQ9D6F9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tubb4aQ9D6F9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tubb4aQ9D6F9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tubb4aQ9D6F9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tubb4aQ9D6F9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tubb4aQ9D6F9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tubb4aQ9D6F9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tubb4aQ9D6F9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tubb4aQ9D6F9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tubb4aQ9D6F9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tubb4aQ9D6F9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tubb4aQ9D6F9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tubb4aQ9D6F9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tubb4aQ9D6F9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tubb4aQ9D6F9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb4aQ9D6F9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb4aQ9D6F9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb4aQ9D6F9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb4aQ9D6F9 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb4aQ9D6F9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb4aQ9D6F9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb4aQ9D6F9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms