Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc9bQ9D6E4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ttc9bQ9D6E4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ttc9bQ9D6E4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ttc9bQ9D6E4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Ttc9bQ9D6E4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc9bQ9D6E4 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc9bQ9D6E4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc9bQ9D6E4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc9bQ9D6E4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc9bQ9D6E4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc9bQ9D6E4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc9bQ9D6E4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc9bQ9D6E4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc9bQ9D6E4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc9bQ9D6E4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc9bQ9D6E4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc9bQ9D6E4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc9bQ9D6E4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc9bQ9D6E4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc9bQ9D6E4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc9bQ9D6E4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc9bQ9D6E4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc9bQ9D6E4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc9bQ9D6E4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc9bQ9D6E4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc9bQ9D6E4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc9bQ9D6E4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc9bQ9D6E4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc9bQ9D6E4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc9bQ9D6E4 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc9bQ9D6E4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc9bQ9D6E4 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc9bQ9D6E4 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc9bQ9D6E4 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc9bQ9D6E4 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc9bQ9D6E4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc9bQ9D6E4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc9bQ9D6E4 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ttc9bQ9D6E4 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms