Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q8

Uncharacterized protein C1orf141 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D5Q8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D5Q8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms