Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Speer4f1Q9D5Q6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Speer4f1Q9D5Q6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms