Protein–RNA interactions for Protein: Q9D549

4930513O06Rik, RIKEN cDNA 4930513O06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930513O06RikQ9D549 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930513O06RikQ9D549 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930513O06RikQ9D549 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930513O06RikQ9D549 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930513O06RikQ9D549 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930513O06RikQ9D549 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930513O06RikQ9D549 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930513O06RikQ9D549 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930513O06RikQ9D549 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930513O06RikQ9D549 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
4930513O06RikQ9D549 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
4930513O06RikQ9D549 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930513O06RikQ9D549 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930513O06RikQ9D549 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930513O06RikQ9D549 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930513O06RikQ9D549 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930513O06RikQ9D549 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930513O06RikQ9D549 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930513O06RikQ9D549 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930513O06RikQ9D549 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930513O06RikQ9D549 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930513O06RikQ9D549 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930513O06RikQ9D549 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930513O06RikQ9D549 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930513O06RikQ9D549 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930513O06RikQ9D549 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930513O06RikQ9D549 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
4930513O06RikQ9D549 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4930513O06RikQ9D549 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930513O06RikQ9D549 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms