Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrameQ9D4Z5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms