Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q4

4930578G10Rik, RIKEN cDNA 4930578G10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930578G10RikQ9D4Q4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
4930578G10RikQ9D4Q4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930578G10RikQ9D4Q4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms