Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lonrf3Q9D4H7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lonrf3Q9D4H7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms