Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms