Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X4

4933428G20Rik, RIKEN cDNA 4933428G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428G20RikQ9D3X4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
4933428G20RikQ9D3X4 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
4933428G20RikQ9D3X4 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms