Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gpn3Q9D3W4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms