Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrnp35Q9D384 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snrnp35Q9D384 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms