Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pramef12Q9D2F1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pramef12Q9D2F1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms