Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SarnpQ9D1J3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SarnpQ9D1J3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SarnpQ9D1J3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SarnpQ9D1J3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SarnpQ9D1J3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SarnpQ9D1J3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SarnpQ9D1J3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SarnpQ9D1J3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SarnpQ9D1J3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SarnpQ9D1J3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SarnpQ9D1J3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SarnpQ9D1J3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SarnpQ9D1J3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SarnpQ9D1J3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SarnpQ9D1J3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SarnpQ9D1J3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SarnpQ9D1J3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SarnpQ9D1J3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SarnpQ9D1J3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SarnpQ9D1J3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SarnpQ9D1J3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SarnpQ9D1J3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SarnpQ9D1J3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SarnpQ9D1J3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SarnpQ9D1J3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SarnpQ9D1J3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SarnpQ9D1J3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SarnpQ9D1J3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms