Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Mrpl28Q9D1B9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms