Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Susd3Q9D176 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms