Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Zbed3Q9D0L1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Zbed3Q9D0L1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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