Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zbed3Q9D0L1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zbed3Q9D0L1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms