Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf2e1Q9D0D5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf2e1Q9D0D5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms