Protein–RNA interactions for Protein: Q9D099

Acer3, Alkaline ceramidase 3, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acer3Q9D099 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acer3Q9D099 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acer3Q9D099 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acer3Q9D099 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acer3Q9D099 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acer3Q9D099 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acer3Q9D099 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acer3Q9D099 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acer3Q9D099 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acer3Q9D099 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acer3Q9D099 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acer3Q9D099 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acer3Q9D099 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acer3Q9D099 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acer3Q9D099 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acer3Q9D099 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acer3Q9D099 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Acer3Q9D099 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Acer3Q9D099 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acer3Q9D099 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acer3Q9D099 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acer3Q9D099 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acer3Q9D099 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acer3Q9D099 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acer3Q9D099 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acer3Q9D099 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acer3Q9D099 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acer3Q9D099 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Acer3Q9D099 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acer3Q9D099 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acer3Q9D099 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Acer3Q9D099 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acer3Q9D099 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acer3Q9D099 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acer3Q9D099 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acer3Q9D099 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acer3Q9D099 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acer3Q9D099 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acer3Q9D099 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acer3Q9D099 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acer3Q9D099 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acer3Q9D099 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Acer3Q9D099 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acer3Q9D099 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Acer3Q9D099 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Acer3Q9D099 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acer3Q9D099 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acer3Q9D099 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acer3Q9D099 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acer3Q9D099 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acer3Q9D099 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acer3Q9D099 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acer3Q9D099 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acer3Q9D099 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acer3Q9D099 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acer3Q9D099 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acer3Q9D099 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Acer3Q9D099 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acer3Q9D099 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acer3Q9D099 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Acer3Q9D099 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Acer3Q9D099 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Acer3Q9D099 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Acer3Q9D099 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acer3Q9D099 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acer3Q9D099 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acer3Q9D099 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acer3Q9D099 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acer3Q9D099 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acer3Q9D099 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acer3Q9D099 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acer3Q9D099 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acer3Q9D099 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acer3Q9D099 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Acer3Q9D099 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acer3Q9D099 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acer3Q9D099 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acer3Q9D099 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acer3Q9D099 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acer3Q9D099 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acer3Q9D099 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acer3Q9D099 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acer3Q9D099 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acer3Q9D099 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acer3Q9D099 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acer3Q9D099 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acer3Q9D099 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acer3Q9D099 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acer3Q9D099 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acer3Q9D099 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acer3Q9D099 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acer3Q9D099 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acer3Q9D099 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acer3Q9D099 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acer3Q9D099 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acer3Q9D099 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acer3Q9D099 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acer3Q9D099 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acer3Q9D099 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Acer3Q9D099 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.5 ms