Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc47Q9D024 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc47Q9D024 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms