Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZX0

Elp3, Elongator complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp3Q9CZX0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Elp3Q9CZX0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Elp3Q9CZX0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Elp3Q9CZX0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Elp3Q9CZX0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Elp3Q9CZX0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Elp3Q9CZX0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Elp3Q9CZX0 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Elp3Q9CZX0 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Elp3Q9CZX0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Elp3Q9CZX0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Elp3Q9CZX0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Elp3Q9CZX0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Elp3Q9CZX0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Elp3Q9CZX0 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Elp3Q9CZX0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Elp3Q9CZX0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Elp3Q9CZX0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Elp3Q9CZX0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Elp3Q9CZX0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Elp3Q9CZX0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Elp3Q9CZX0 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Elp3Q9CZX0 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Elp3Q9CZX0 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Elp3Q9CZX0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Elp3Q9CZX0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Elp3Q9CZX0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Elp3Q9CZX0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Elp3Q9CZX0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms