Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shmt2Q9CZN7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Shmt2Q9CZN7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms