Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Shisa9Q9CZN4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Shisa9Q9CZN4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms