Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mis12Q9CY25 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms