Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

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Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bud23Q9CY21 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Bud23Q9CY21 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Bud23Q9CY21 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bud23Q9CY21 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms