Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snx7Q9CY18 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx7Q9CY18 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms