Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Sgo1Q9CXH7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sgo1Q9CXH7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sgo1Q9CXH7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sgo1Q9CXH7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sgo1Q9CXH7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sgo1Q9CXH7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sgo1Q9CXH7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sgo1Q9CXH7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sgo1Q9CXH7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sgo1Q9CXH7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sgo1Q9CXH7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sgo1Q9CXH7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sgo1Q9CXH7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sgo1Q9CXH7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sgo1Q9CXH7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sgo1Q9CXH7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sgo1Q9CXH7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sgo1Q9CXH7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sgo1Q9CXH7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Sgo1Q9CXH7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sgo1Q9CXH7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sgo1Q9CXH7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sgo1Q9CXH7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sgo1Q9CXH7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sgo1Q9CXH7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sgo1Q9CXH7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sgo1Q9CXH7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sgo1Q9CXH7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sgo1Q9CXH7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sgo1Q9CXH7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sgo1Q9CXH7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sgo1Q9CXH7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sgo1Q9CXH7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sgo1Q9CXH7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sgo1Q9CXH7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sgo1Q9CXH7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sgo1Q9CXH7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms