Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX30

Yif1b, Protein YIF1B, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yif1bQ9CX30 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Yif1bQ9CX30 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms