Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Utp23Q9CX11 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Utp23Q9CX11 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Utp23Q9CX11 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Utp23Q9CX11 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Utp23Q9CX11 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Utp23Q9CX11 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Utp23Q9CX11 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Utp23Q9CX11 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Utp23Q9CX11 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Utp23Q9CX11 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Utp23Q9CX11 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Utp23Q9CX11 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Utp23Q9CX11 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Utp23Q9CX11 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Utp23Q9CX11 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Utp23Q9CX11 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Utp23Q9CX11 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Utp23Q9CX11 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Utp23Q9CX11 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Utp23Q9CX11 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Utp23Q9CX11 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Utp23Q9CX11 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Utp23Q9CX11 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Utp23Q9CX11 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Utp23Q9CX11 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Utp23Q9CX11 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Utp23Q9CX11 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Utp23Q9CX11 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Utp23Q9CX11 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Utp23Q9CX11 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Utp23Q9CX11 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Utp23Q9CX11 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Utp23Q9CX11 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Utp23Q9CX11 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Utp23Q9CX11 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Utp23Q9CX11 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Utp23Q9CX11 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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