Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prkrip1Q9CWV6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Prkrip1Q9CWV6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Prkrip1Q9CWV6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Prkrip1Q9CWV6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prkrip1Q9CWV6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prkrip1Q9CWV6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Prkrip1Q9CWV6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prkrip1Q9CWV6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prkrip1Q9CWV6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prkrip1Q9CWV6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prkrip1Q9CWV6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Prkrip1Q9CWV6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prkrip1Q9CWV6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prkrip1Q9CWV6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prkrip1Q9CWV6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prkrip1Q9CWV6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prkrip1Q9CWV6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prkrip1Q9CWV6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prkrip1Q9CWV6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prkrip1Q9CWV6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prkrip1Q9CWV6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prkrip1Q9CWV6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prkrip1Q9CWV6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prkrip1Q9CWV6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prkrip1Q9CWV6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prkrip1Q9CWV6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prkrip1Q9CWV6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prkrip1Q9CWV6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prkrip1Q9CWV6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prkrip1Q9CWV6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prkrip1Q9CWV6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prkrip1Q9CWV6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prkrip1Q9CWV6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prkrip1Q9CWV6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prkrip1Q9CWV6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prkrip1Q9CWV6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prkrip1Q9CWV6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prkrip1Q9CWV6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prkrip1Q9CWV6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Prkrip1Q9CWV6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prkrip1Q9CWV6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prkrip1Q9CWV6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prkrip1Q9CWV6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prkrip1Q9CWV6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prkrip1Q9CWV6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prkrip1Q9CWV6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prkrip1Q9CWV6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prkrip1Q9CWV6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prkrip1Q9CWV6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prkrip1Q9CWV6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prkrip1Q9CWV6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prkrip1Q9CWV6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Prkrip1Q9CWV6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prkrip1Q9CWV6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Prkrip1Q9CWV6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prkrip1Q9CWV6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms