Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx28Q9CWT6 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddx28Q9CWT6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms