Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM2

Cdca4, Cell division cycle-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca4Q9CWM2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdca4Q9CWM2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdca4Q9CWM2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdca4Q9CWM2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdca4Q9CWM2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdca4Q9CWM2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdca4Q9CWM2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdca4Q9CWM2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdca4Q9CWM2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdca4Q9CWM2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdca4Q9CWM2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdca4Q9CWM2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdca4Q9CWM2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdca4Q9CWM2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdca4Q9CWM2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdca4Q9CWM2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdca4Q9CWM2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdca4Q9CWM2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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