Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUS9

Sppl3, Signal peptide peptidase-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl3Q9CUS9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sppl3Q9CUS9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sppl3Q9CUS9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sppl3Q9CUS9 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sppl3Q9CUS9 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sppl3Q9CUS9 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sppl3Q9CUS9 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sppl3Q9CUS9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sppl3Q9CUS9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sppl3Q9CUS9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sppl3Q9CUS9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sppl3Q9CUS9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sppl3Q9CUS9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sppl3Q9CUS9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sppl3Q9CUS9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sppl3Q9CUS9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sppl3Q9CUS9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sppl3Q9CUS9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sppl3Q9CUS9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sppl3Q9CUS9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms