Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ5

4930524J08Rik, RIKEN cDNA 4930524J08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930524J08RikQ9CUJ5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
4930524J08RikQ9CUJ5 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms