Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUI2

4930535I16Rik, RIKEN cDNA 4930535I16 gene (Fragment), mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930535I16RikQ9CUI2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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4930535I16RikQ9CUI2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
4930535I16RikQ9CUI2 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
4930535I16RikQ9CUI2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
4930535I16RikQ9CUI2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
4930535I16RikQ9CUI2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
4930535I16RikQ9CUI2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
4930535I16RikQ9CUI2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
4930535I16RikQ9CUI2 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
4930535I16RikQ9CUI2 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
4930535I16RikQ9CUI2 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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4930535I16RikQ9CUI2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
4930535I16RikQ9CUI2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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4930535I16RikQ9CUI2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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4930535I16RikQ9CUI2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
4930535I16RikQ9CUI2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
4930535I16RikQ9CUI2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
4930535I16RikQ9CUI2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
4930535I16RikQ9CUI2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
4930535I16RikQ9CUI2 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
4930535I16RikQ9CUI2 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
4930535I16RikQ9CUI2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
4930535I16RikQ9CUI2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
4930535I16RikQ9CUI2 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
4930535I16RikQ9CUI2 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
4930535I16RikQ9CUI2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
4930535I16RikQ9CUI2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
4930535I16RikQ9CUI2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
4930535I16RikQ9CUI2 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
4930535I16RikQ9CUI2 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
4930535I16RikQ9CUI2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
4930535I16RikQ9CUI2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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4930535I16RikQ9CUI2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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4930535I16RikQ9CUI2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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4930535I16RikQ9CUI2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
4930535I16RikQ9CUI2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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4930535I16RikQ9CUI2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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4930535I16RikQ9CUI2 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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4930535I16RikQ9CUI2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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4930535I16RikQ9CUI2 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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4930535I16RikQ9CUI2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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4930535I16RikQ9CUI2 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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4930535I16RikQ9CUI2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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4930535I16RikQ9CUI2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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4930535I16RikQ9CUI2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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4930535I16RikQ9CUI2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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4930535I16RikQ9CUI2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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4930535I16RikQ9CUI2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930535I16RikQ9CUI2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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