Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Otud1Q9CUB6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud1Q9CUB6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms