Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fcf1Q9CTH6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fcf1Q9CTH6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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