Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTG6

Atp13a2, Cation-transporting ATPase 13A2, mousemouse

Predictions only

Length 1,169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a2Q9CTG6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp13a2Q9CTG6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a2Q9CTG6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms