Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS84

Nrxn1, Neurexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrxn1Q9CS84 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nrxn1Q9CS84 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nrxn1Q9CS84 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nrxn1Q9CS84 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nrxn1Q9CS84 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nrxn1Q9CS84 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nrxn1Q9CS84 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nrxn1Q9CS84 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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Nrxn1Q9CS84 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nrxn1Q9CS84 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nrxn1Q9CS84 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
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Nrxn1Q9CS84 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nrxn1Q9CS84 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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Nrxn1Q9CS84 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nrxn1Q9CS84 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nrxn1Q9CS84 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nrxn1Q9CS84 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nrxn1Q9CS84 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nrxn1Q9CS84 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nrxn1Q9CS84 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nrxn1Q9CS84 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nrxn1Q9CS84 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nrxn1Q9CS84 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Nrxn1Q9CS84 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nrxn1Q9CS84 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nrxn1Q9CS84 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nrxn1Q9CS84 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nrxn1Q9CS84 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nrxn1Q9CS84 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nrxn1Q9CS84 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nrxn1Q9CS84 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nrxn1Q9CS84 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nrxn1Q9CS84 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nrxn1Q9CS84 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Nrxn1Q9CS84 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nrxn1Q9CS84 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nrxn1Q9CS84 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Nrxn1Q9CS84 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Nrxn1Q9CS84 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Nrxn1Q9CS84 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Nrxn1Q9CS84 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nrxn1Q9CS84 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nrxn1Q9CS84 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nrxn1Q9CS84 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nrxn1Q9CS84 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Nrxn1Q9CS84 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Nrxn1Q9CS84 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nrxn1Q9CS84 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
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Nrxn1Q9CS84 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nrxn1Q9CS84 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nrxn1Q9CS84 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nrxn1Q9CS84 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nrxn1Q9CS84 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Nrxn1Q9CS84 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nrxn1Q9CS84 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Nrxn1Q9CS84 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nrxn1Q9CS84 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nrxn1Q9CS84 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nrxn1Q9CS84 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nrxn1Q9CS84 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nrxn1Q9CS84 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nrxn1Q9CS84 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nrxn1Q9CS84 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nrxn1Q9CS84 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nrxn1Q9CS84 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nrxn1Q9CS84 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nrxn1Q9CS84 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nrxn1Q9CS84 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nrxn1Q9CS84 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nrxn1Q9CS84 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nrxn1Q9CS84 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nrxn1Q9CS84 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nrxn1Q9CS84 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nrxn1Q9CS84 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Nrxn1Q9CS84 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nrxn1Q9CS84 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nrxn1Q9CS84 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nrxn1Q9CS84 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nrxn1Q9CS84 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Nrxn1Q9CS84 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nrxn1Q9CS84 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Nrxn1Q9CS84 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nrxn1Q9CS84 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms