Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Atg12Q9CQY1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms