Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ndufb9Q9CQJ8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms