Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrpb2Q9CQI7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms