Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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RTRAFQ9CQE8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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RTRAFQ9CQE8 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RTRAFQ9CQE8 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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