Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CQC3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CQC3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CQC3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CQC3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CQC3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9CQC3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms