Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC2

Clps, Colipase, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpsQ9CQC2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ClpsQ9CQC2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClpsQ9CQC2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClpsQ9CQC2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClpsQ9CQC2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClpsQ9CQC2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClpsQ9CQC2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClpsQ9CQC2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClpsQ9CQC2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClpsQ9CQC2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClpsQ9CQC2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClpsQ9CQC2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClpsQ9CQC2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClpsQ9CQC2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClpsQ9CQC2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClpsQ9CQC2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ClpsQ9CQC2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClpsQ9CQC2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClpsQ9CQC2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClpsQ9CQC2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClpsQ9CQC2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClpsQ9CQC2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClpsQ9CQC2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClpsQ9CQC2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClpsQ9CQC2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClpsQ9CQC2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClpsQ9CQC2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClpsQ9CQC2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClpsQ9CQC2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClpsQ9CQC2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClpsQ9CQC2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClpsQ9CQC2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClpsQ9CQC2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClpsQ9CQC2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClpsQ9CQC2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ClpsQ9CQC2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ClpsQ9CQC2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClpsQ9CQC2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClpsQ9CQC2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClpsQ9CQC2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClpsQ9CQC2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClpsQ9CQC2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClpsQ9CQC2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClpsQ9CQC2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClpsQ9CQC2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ClpsQ9CQC2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClpsQ9CQC2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClpsQ9CQC2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClpsQ9CQC2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClpsQ9CQC2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClpsQ9CQC2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ClpsQ9CQC2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ClpsQ9CQC2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ClpsQ9CQC2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ClpsQ9CQC2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ClpsQ9CQC2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ClpsQ9CQC2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms