Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ84

Ubl4b, Ubiquitin-like protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl4bQ9CQ84 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ubl4bQ9CQ84 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ubl4bQ9CQ84 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ubl4bQ9CQ84 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ubl4bQ9CQ84 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Ubl4bQ9CQ84 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Ubl4bQ9CQ84 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ubl4bQ9CQ84 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ubl4bQ9CQ84 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ubl4bQ9CQ84 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ubl4bQ9CQ84 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ubl4bQ9CQ84 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ubl4bQ9CQ84 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ubl4bQ9CQ84 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ubl4bQ9CQ84 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ubl4bQ9CQ84 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Ubl4bQ9CQ84 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ubl4bQ9CQ84 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ubl4bQ9CQ84 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ubl4bQ9CQ84 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ubl4bQ9CQ84 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ubl4bQ9CQ84 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ubl4bQ9CQ84 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Ubl4bQ9CQ84 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ubl4bQ9CQ84 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ubl4bQ9CQ84 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ubl4bQ9CQ84 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ubl4bQ9CQ84 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ubl4bQ9CQ84 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ubl4bQ9CQ84 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ubl4bQ9CQ84 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ubl4bQ9CQ84 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ubl4bQ9CQ84 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ubl4bQ9CQ84 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ubl4bQ9CQ84 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ubl4bQ9CQ84 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ubl4bQ9CQ84 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ubl4bQ9CQ84 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ubl4bQ9CQ84 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ubl4bQ9CQ84 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Ubl4bQ9CQ84 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Ubl4bQ9CQ84 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ubl4bQ9CQ84 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ubl4bQ9CQ84 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ubl4bQ9CQ84 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms