Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkp2Q9CQ73 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms