Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpa3Q9CQ71 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms