Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ47

4921530L21Rik, RIKEN cDNA 4921530L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921530L21RikQ9CQ47 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4921530L21RikQ9CQ47 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4921530L21RikQ9CQ47 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms